?

Log in

No account? Create an account
 
 
17 February 2010 @ 09:51 pm
for those biologically inclined  
So it was quite an interesting discussion of the principal conceptual breakthroughs in biology - this is how I would define the subject. It is sort of a cross-section of "principles" and "discoveries". Not just great discoveries - as some commentators noted, Pasteur made many, and Avery's discovery of the genetic function of DNA stands next to none. But, the discussion was about a special kind of discoveries: discoveries revealing principles, even if this is an awkward phrase. Even with this understanding, people pointed out additional principles, and important ones, indeed, like biological(biochemical), membranes and more. Upon some thinking, this prompts me to move to a more abstract level and formulate a single governing principle:

Replication with an error rate below the error catastrophe threshold

Everything else is, at least "in principle", is implied by this one:
compartmentalization, catalysis, energy conversion systems, metabolism,
the possibility for extensive (though not unlimited) increase in complexity etc
 
 
 
Esyaesya on February 18th, 2010 04:01 am (UTC)
Да, тут мутации включены. Ведь каждая из полимераз ошибается на свой манер, с точно отрегулированной частотой и качеством ошибок. И репарация имеет немного общих черт у разных организмов, детали сильно отличаются.

Но вторичные принципы, тоже немногочисленны и не менее важны.
Yegor Voroninshvarz on February 18th, 2010 03:39 pm (UTC)
с точно отрегулированной частотой и качеством ошибок

И кто-то меня упрекал в редукционизме?!

Это все равно что сказать, что каждый организм идеально приспособлен к своей среде обитания. Частота и качество ошибок репликации сегодня сформированы под действием отбора в прошлом и ограничены историческим контекстом уже существовавших полимераз.
Esyaesya on February 18th, 2010 03:42 pm (UTC)
это не редукционизм, это поэзия :)Там все жутко гибко, одну аминокислоту замени.
myugormyugor on February 18th, 2010 05:21 pm (UTC)
Да, но сам ваш governing principle, скорее всего, сводится к определенному классу квазициклических траекторий в фазовом пространстве, в котором "compartmentalization, catalysis, energy conversion systems & metabolism", или их функционалы - (некоторые, не все) независимые размерности.
Eugene V Koonineugene_koonin on February 18th, 2010 05:25 pm (UTC)
That is probably formally true but to me this seems to be at a level of abstraction that is too high to be useful for understanding biology...although I would be interested to be proved wrong.